Program Zero Waste merupakan salah satu program yang dirancang oleh SMK Negeri 3 Denpasar dalam rangka penanggulangan sampah terutama di lingkungan sekolah. Zero Waste sebenarnya sudah terlaksana dari beberapa tahun lalu, namun kegiatannya belum maksimal.

Kemudian mulai tanggal 27 Pebruari 2023, SMKN 3 Denpasar kembali menggalakkan Program Zero Waste ini.  Kegiatan zero waste kali ini akan melibatkan semua siswa, dimana setiap hari, yaitu mulai dari hari senin – jumat, siswa akan digilir per kelas untuk untuk piket atau bekerja seperti mengangkut sampah, memilah sampah, mengemas, mendaur ulang, membuat ecoenzym, penelitian sederhana dan pembuatan laporan. Kegiatan ini mulai dilaksanakan pada tanggal 27 pebruari 2023, mulai dari kelas X Kuliner B1 dan didampingi oleh semua guru yang mengajar di kelas tersebut. Harapan dari program ini adalah upaya untuk penanggulangan sampah di sekolah, sehingga SMKN 3 Denpasar terbebas dari sampah.